研發(fā)費用加計扣除與高新企業(yè)認定之間存在著這樣的辯證關(guān)系：能加計扣除的企業(yè)不一定是高新技術(shù)企業(yè)，但高新技術(shù)企業(yè)必然有研發(fā)費加計扣除項目。

由于高新企業(yè)同時享受加計扣除的優(yōu)惠，兩者的歸集口徑容易就混淆了。 高新技術(shù)企業(yè)的研發(fā)費用范圍一般大于研發(fā)費加計扣除的范圍。 比如說折舊費，對于建筑物的折舊費不能加計扣除，而高新可以。對于經(jīng)營租賃費加計扣除只允許用于研發(fā)的儀器、設(shè)備租賃費，廠房不可以加計，而高新可以。高新研發(fā)費用包括裝備調(diào)試費用，田間實施費，加計扣除不包括。高新研發(fā)費用包括通訊費，加計扣除也不包括。委托研發(fā)的，高新包括委托境內(nèi)外研發(fā)，而加計扣除只能是委托境內(nèi)機構(gòu)或個人。其他相關(guān)費用高新規(guī)定不得*過研究開發(fā)總費用的20%，而加計扣除規(guī)定是不得*過10%。高新的研發(fā)費用口徑不包括職工福利費，補充養(yǎng)老和補充醫(yī)療保險，而研發(fā)費用加計扣除可以。對研發(fā)人員的定義，高新研發(fā)費用只要是企業(yè)科技人員都可歸集，加計扣除必須是直接從事研發(fā)活動的人員。不過，對科技人員，高新要求累計實際工作時間在183天以上，而加計扣除沒有這個要求。

共有8個不同點

一、研發(fā)活動及研發(fā)費用歸集范圍       

允許加計扣除的研發(fā)費用。

企業(yè)開展研發(fā)活動中實際發(fā)生的研發(fā)費用，未形成無形資產(chǎn)計入當期損益的，在按規(guī)定據(jù)實扣除的基礎(chǔ)上，按照本年度實際發(fā)生額的50%，從本年度應(yīng)納稅所得額中扣除；形成無形資產(chǎn)的，按照無形資產(chǎn)成本的150%在稅前攤銷。研發(fā)費用的具體范圍包括：

1.人員人工費用。 直接從事研發(fā)活動人員的工資薪金、基本養(yǎng)老保險費、基本醫(yī)療保險費、失業(yè)保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金，以及外聘研發(fā)人員的勞務(wù)費用。

2.直接投入費用。

（1）研發(fā)活動直接消耗的材料、燃料和動力費用。

（2）用于中間試驗和產(chǎn)品試制的模具、工藝裝備開發(fā)及制造費，不構(gòu)成固定資產(chǎn)的樣品、樣機及一般測試手段購置費，試制產(chǎn)品的檢驗費。 （3）用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備的運行維護、調(diào)整、檢驗、維修等費用，以及通過經(jīng)營租賃方式租入的用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備租賃費。 3.折舊費用。 用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備的折舊費。

4.無形資產(chǎn)攤銷。 用于研發(fā)活動的軟件、專利權(quán)、非專利技術(shù)（包括許可證、專有技術(shù)、設(shè)計和計算方法等）的攤銷費用。

5.新產(chǎn)品設(shè)計費、新工藝規(guī)程制定費、新藥研制的臨床試驗費、勘探開發(fā)技術(shù)的現(xiàn)場試驗費。

6.其他相關(guān)費用。 與研發(fā)活動直接相關(guān)的其他費用，如技術(shù)圖書資料費、資料翻譯費、專家咨詢費、高新科技研發(fā)保險費，研發(fā)成果的檢索、分析、評議、論證、鑒定、評審、評估、驗收費用，知識產(chǎn)權(quán)的申請費、注冊費、代理費，差旅費、會議費等。此項費用總額不得*過可加計扣除研發(fā)費用總額的10%。

7.財政部和國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他費用。

二、研發(fā)費用補貼申報標準 （以深圳市為例）

（一）在深圳市依法注冊、具有獨立法人資格的企業(yè)，或深汕特別合作區(qū)內(nèi)的深圳企業(yè)；

（二）按照國家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)研究開發(fā)費用稅前加計扣除政策有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第97號）要求對研發(fā)費用進行歸集并設(shè)置輔助賬；

（三）銷售收入2000萬元及以上的企業(yè)應(yīng)建立了內(nèi)部研發(fā)機構(gòu)；

（四）企業(yè)開展的研發(fā)活動應(yīng)符合《國家重點支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》所規(guī)定的范圍。

很多做了加計扣除的企業(yè)、或者做了國高的企業(yè)均未享受到研發(fā)資助。具體原因存在幾種情況：
一、辦理了加計扣除優(yōu)惠備案的企業(yè)
1、沒有填報科技統(tǒng)計報表的企業(yè)。將取消今年的資助資格。做好明年的填報工作，可享受明年的研究開發(fā)資助；
2、填報了科技統(tǒng)計報表的企業(yè)。但由于企業(yè)填報質(zhì)量問題，導致國家統(tǒng)計局核定的研發(fā)投入為0，沒有研發(fā)機構(gòu)。請企業(yè)認真查找原因，找不到原因的，請與統(tǒng)計部門聯(lián)系，幫助查找，明年填報時認真整改。否則，將會影響明年的資助。
3、連續(xù)兩年存在科創(chuàng)委的數(shù)據(jù)與報國家統(tǒng)計報表數(shù)據(jù)誤差*出正常范圍的企業(yè)。市科創(chuàng)委將與市統(tǒng)計局相商進行處理。

二、未辦理加計扣除優(yōu)惠備案的企業(yè)
待評審結(jié)束后，公布結(jié)果。（申報企業(yè)必須辦理加計扣除優(yōu)惠備案，以在稅務(wù)部門備案的研發(fā)支出數(shù)計算資助金額。）